NCBI []
NCBI (National Center for Biotechnology Information）是指美国国立生功用技术中心等
EMBL []
欧洲底物生功用学实验者室EMBL（The European Molecular Biology Laboratory）
DDBJ []
DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年建立，是世上三大DNA 检索之一，与NCBI的GenBank，EMBL的EBI检索主导组成的国际DNA检索
CNGB []
中国发展中国家检索（China National GeneBank）位于深圳大鹏新区，是继世上三大检索以后的全球第四大发展中国家级检索。它是中国首个，也是唯一一个发展中国家品系，一般来说全球另外三个品系而言，发展中国家品系样品保存的规模、存储量和可访问的数据库量皆是全球最大。
BIGD []
中国发展中国家性状组科学数据库中心 生命与健康大数据库中心 (National Genomics Data Center BIG Data Center)
2、非UTF-RNA检索（1）.非UTF-小RNA检索miRBase []
piRNAbank []
piRNAbank []
SILVA []
（2）.长非UTF-RNA检索：LncRNAdb []
真核蛋白生功用
LncRNAwiki [_Page]
人类长非UTF-RNA检索
（3）.非UTF-RNA后裔检索Rfam[]
类似于Pfam的RNA后裔编者检索
（4）.非UTF-RNA性状序列检索RNAcentral [ ]3、多肽检索（1）.多肽信息Human protein atlas [ ]
人体肽在蛋白、组织、病理条件下的暗示
（2）.肽性状序列检索Pfam []
Pfam是多肽后裔的检索，以外使用容马尔可夫模型生成的编者和多性状序列统计分析。
SwissProt []
手动编者的非数据库流肽性状序列检索
UniProt [ ]
PIR []
Antibodies []
BRENDA [ ]
HPRD []
InterPro []
通过整合多个肽方面检索，提供了一个方便的对肽性状序列进行时动态编者的平台，以外对多肽后裔、构件域、动态位点的数据分析
iProClass []
PRF []
REBASE []
（3）.多肽构件检索PDB []
通过实验者测可知的构件
SCOP []
CATH []
PSI []
（4）.肽组检索PRIDE []（5）.多肽动态域检索PROSITE []
最全面
Pfam []
最专业知识
ProDom []
CCD []
Prints []
SMART [ ]
TIGRFAM []
（6）.肽互作检索STRING []
DIP []
实验者验证的肽相互抑制作用检索
BioGRID [] ：
IntAct [ ]
4、细胞内检索MapMan：一个动态强大的细胞内途径查看和编辑软件
（1）.细胞内途径检索KEGG []
GO []
NCBI BioSystems []
IMP []
plantCyc []
MANET [ ]
MetaNetX [ ]
（2）.细胞内组学都用检索MataboLights []
HMDB []
YMDB []
ECMDB []
（3）.表型检索Planteome []
dbGaP []
IPPN []
5、性状序列统计分析（1）.性状序列与检索统计分析Blast []（2）.多性状序列在在统计分析Clustal（3）.性状序列进化树归纳MEGA6、性状归纳（1）.性状信息GeneCard []
Gene Wiki[_Wiki ]
（2）.性状编者Blast []
Interproscan []，
WEGO []
KAAS []
（3）.性状动态数据分析：FGENESH []
AUGUSTUS [ ]
GENESCAN []
GeneMark []
Glimmer []
（4）.性状构件数据分析Exon-Intron Graphic Maker []
根据候选性状的外显子和碱基等信息所画性状构件
Blastp [_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome]
可的网站获取肽构件域的编者和位置信息
（5）.词源性状归纳OrthoDB是直系词源功用的综合录入[]（6）.亚蛋白整合数据分析PSORT Prediction []（7）.组蛋白归纳Plantcare []（8）.调控借此性状的miRNA数据分析psRNAtarget []（9）.暗示归纳ArrayExpress [ ]
数据库来自EMBL的高通量动态性状组学实验者的数据库；
BAR []
在归纳性状动态时，通常但会参考性状的暗示模式，即性状在植功用相同组织相同发育时期的暗示稀土类型变化。通过的网站归纳网站BAR对候性状进行时暗示归纳。 是一个植功用生信归纳森林资源网站，用该网站归纳性状暗示时，不仅可以获得性状暗示模式的热图，还可以获得建模的电子产品荧光相片，直观呈现性状在植功用组织中的暗示位置。
（10）.性状构件所画GSDS []
Gene Structure Display Server，基于性状组编者档案所画性状序列性状构件等动态
7、多肽归纳（1）.肽二级三级构件数据分析及绘图CFSSP []SOPMA [_automat.pl?page=npsa_sopma.html]PredictProtein []SWISS-MODEL []（2）.肽连续性归纳ProtParam []
肽连续性归纳是指肽的一些功用理和化学参数，如底物量、等电点、和水分子组成、消光分量、半衰期、不稳可知分量、脂肪族指数、鱼池性。这些参数，有助于进行时肽的方面生化实验者。比如在体外经济制度（病原、酿酒酵母等）暗示和产物借此肽时，需要顾虑肽的底物量、等电点、消光分量、不稳可知分量和鱼池性等。在蛋白活实验者中，也需要根据这些参数优化实验者经济制度。
（3）.肽亲属沙质归纳Protscale []
肽的亲属沙质主要由其侧链自由基R，如果R只是H或是C、H两类型组成的话，都是神宗水的，如果含有溶剂侧链自由基，如-OH、-SH、-COOH、-NH2 等，则就是溶剂的（鱼池的）。神宗沙质有酪氨酸、色氨酸、苯丝氨酸、吲哚、亮氨酸、异亮氨酸、丝氨酸和蛋氨酸（甲硫氨酸）。神宗沙质在多肽之外，在保持一致多肽的三级构件上，蛋白和基质、抗体和上皮细胞在在的相互抑制作用等各种非氢键的底物建构方面，具有关键抑制作用。
（4）.一环管壁构件归纳TMHMM []
肽的一环管壁构件归纳对于数据分析肽的亚蛋白整合密切方面。如果具有一环管壁构件，肽很不太可能整合于蛋白中与管壁方面的构件，如多肽管壁、蛋白器管壁或氨化管壁等内管壁系统。此外，肽一环管壁构件归纳对于肽动态归纳也有一可知的帮助。比如某肽没有一环管壁构件，但是亚蛋白整合实验者表明其可整合于管壁方面构件，这所述该肽不太可能通过其他管壁整合肽招募过去的。
（5）.接收机肽归纳SignalP []
穹丘接收机位置为接收机肽切割点，穹丘之前的性状序列为接收机肽
接收机肽是指借助新催化的多肽向黏液通路移到的粗肽链，常位于肽的N-末端，全权负责把多肽借助到相同管壁构件的亚蛋白器内。UTF-黏液肽的mRNA在译成时首先催化N末端的接收机肽，它被接收机肽识别肽(SRP)所识别，SRP将多肽载有至溶蛋白体上，溶蛋白体管壁上的 SPR 蛋白识别并与之建构。新催化肽在接收机肽借助下到达溶蛋白体内腔，而接收机肽则在接收机肽蛋白的抑制作用下被切除。由于它的借助，新生的就能够通过溶蛋白体管壁进入腔内，最终被黏液到胞外。在宿主酵母中暗示简而言之肽时，可用接收机肽借助简而言之肽整合黏液到胞外，提高肽可溶性，在原核暗示系统（病原、芽孢杆酵母等）和真核蛋白暗示系统（如毕赤酿酒酵母）中均有应用。
（6）.氨化位点归纳NetPhos []
KinasePhos-2.0 []
多肽氨化指由多肽移到蛋白催化的把 ATP 的氨基移到到底功用多肽残基（丝氨酸、胺基、酪氨酸）上的过程，或者在接收机抑制作用下建构 GTP（通常以 GTP 取代 GDP），是生功用体内一种普通的适度方式则，在蛋白接收机转导的过程中起关键抑制作用。在接收机达到时通过获得一个或几个氨集团而被激活，而在接收机减弱时能去除这些集团，从而夺去活性。有时某个接收机肽氨化通常致使下游的肽依次频发氨化，呈现出氨化反馈反应。
二、生功用信息学软件及下载链接：
Clustal:
MEGA:
MAFFT:
Sequence Matrix:
PGDSpider:
DnaSP v6:
Arlequin:
MapMan：
PartitionFinder:
jModelTest:
IQ-TREE:
IQ-TREE的网站:
RaxmlGUI:
Mrbayes 3.2.7:
PhyloSuite:
BEAST:
Figtree:
Tracer:
PopART:
Network:
Structure:
CLUMMP:
Distruct:
Migrate-N:
Phylonet: 或
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